在房地产开发项目的生命周期中，土地增值税清算作为关键环节之一，必然的联系到企业的税务负担与经济效益。通常情况下，前期工程费用涵盖规划、设计、可行性研究、“三通一平”等为使土地达到施工条件所必需的成本支出。然而在真实的操作中，前期工程费往往存在各式各样问题。

  甲房地产有限公司在2019年于A市开发一处房地产项目，于2021年6月启动竣工验收备案流程，2021年11月18日完成备案。2023年项目所在地主管税务机关要求公司进行土地增值税清算申报。

  甲公司在土地增值税清算申报中，将竣工验收阶段发生的以下费用计入“前期工程费”：

  甲公司于2021年6月已进入竣工验收阶段，此时发生的围挡、桩基检测等费用属于竣工验收必要支出，而非前期开发活动，不得归入“前期工程费”。因此税务机关，要求企业调减相关成本220,000.00元。

  企业回应：围挡、护栏等费用为项目整体施工的必要延续，应视为前期工程的自然延伸。

  税务机关反驳：费用发生时间晚于主体工程完工，与前期开发无因果关系；若属于竣工验收必要支出，应列入“开发间接费”或“竣工验收专项费用”，而非前期工程费。

  根据，前期工程费指项目开发前期的规划、设计、水文地质勘查、通水通电通路及场地平整等支出。

  上述案例中，企业涉及税务风险点有：混淆“前期工程费”与“竣工验收费用”的归属期间，人为扩大扣除范围；成本凭证时间与项目进度矛盾，缺乏逻辑合理性支撑。

  因此，企业在实操中应严格界定成本归集节点；竣工验收阶段费用单独归集，不得混入前期成本；保留完整的合同、付款凭证、工程进度表，确保成本与开发阶段匹配。

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